Jonathan Silva è un difensore del Getafe che non ha preso parte a molte delle sfide del club in Primera División nel 2021/2022, avendo collezionato 9 presenze, per un totale di 220 minuti. È partito titolare in 1 di queste presenze su 38 giornate ed è stato spesso utilizzato come subentrato, in 8 occasioni.
Silva ha collezionato la sua ultima presenza il 12 febbraio, con il Getafe: una sconfitta per 4-3 contro l'Atletico Madrid, in cui ha giocato solamente 9 minuti. Ha ricevuto 4 cartellini gialli.
Nell'ultima stagione con Leganés in Segunda División Silva ha collezionato 17 presenze, gare in cui ha fornito 4 passaggi vincenti.
Il difensore ha iniziato la sua esperienza con il Getafe nell'agosto 2021, mentre prima giocava con Leganés, con cui ha collezionato 82 presenze in campionato, con 4 gol e 12 assist.
All'età di 24 anni e 52 giorni, Silva ha iniziato bene la sua carriera in Primera División, il 20 agosto 2018, con Leganés. Il difensore ha segnato un gol nella sua prima presenza nella competizione, contro l'Athletic Bilbao. La prima presenza con la sua attuale squadra, il Getafe, in Primera División è stata nella gara contro l'Elche il 13 settembre 2021.
In generale, in Primera División, ha giocato 72 gare con 4 gol segnati e 8 assist per i compagni.