Stanislav Magkeev Lokomotiv Moskva è sceso in campo nella maggior parte delle partite della sua squadra in Premier League nel 2020/2021, avendo collezionato 24 presenze, per un totale di 1247 minuti. É stato scelto nell'11 iniziale in 12 di queste presenze, su 30 giornate, ed è stato utilizzato da subentrato in 12 occasioni.
La sua ultima apparizione nella competizione è stata il 16 maggio, partita in cui ha giocato 45 minuti con la maglia Lokomotiv Moskva contro Ural, nella vittoria per 1-0. Ha ricevuto 6 cartellini gialli.
Nella passata stagione di PFL Magkeev ha giocato 2 partite con Kazanka.
Prima di arrivare a vestire la maglia Lokomotiv Moskva nel maggio 2019, Magkeev ha collezionato 21 presenze in campionato con Kazanka, per un totale di 4 gol.