Emanuel Aguilera del Defensa y Justicia ha giocato nella maggior parte delle gare della sua squadra in Liga Profesional Argentina nel 2025, avendo collezionato 17 presenze, per un totale di 1180 minuti. É stato scelto nell'11 iniziale in 14 presenze su 32 giornate ed è subentrato 3 volte.
L'ultima partita di Aguilera in campionato risale al 27 settembre, gara in cui ha giocato solamente un minuto con la maglia del Defensa y Justicia contro il Boca Juniors, nella vittoria per 2-1.
Aguilera ha giocato 34 partite di Liga Profesional Argentina nell'ultima stagione con il Defensa y Justicia.
Il difensore ha iniziato la sua esperienza con il Defensa y Justicia nel gennaio 2024, mentre prima giocava con Tigre, con cui ha collezionato 19 presenze in campionato.