Fabio Gerli del Modena è sceso in campo nella maggior parte delle gare della sua squadra in Serie B nel 2023/2024, avendo collezionato 24 presenze, per un totale di 2013 minuti. É stato scelto nell'11 iniziale in 22 presenze su 38 giornate ed è subentrato 2 volte.
Il centrocampista ha giocato la sua ultima gara il 16 marzo, con Modena: un pareggio per 1-1 contro il Cittadella, in cui ha giocato 90 minuti. In totale il centrocampista ha realizzato 1 rete nel 2023/2024; ha inoltre offerto 3 assist. Ha ricevuto 4 cartellini gialli.
Il suo primo gol nel campionato è arrivato in un pareggio 2-2 contro il Venezia il 18 febbraio.
Nell'ultima stagione con Modena in Serie B Gerli ha collezionato 35 presenze, gare in cui ha segnato 2 gol e fornito 1 assist vincente.
Prima di arrivare a vestire la maglia del Modena nell'agosto 2020, Gerli ha collezionato 25 presenze in campionato con Siena, per un totale di 1 gol.