Marin Pongracic è un difensore del Lecce che è sceso in campo nella maggior parte delle gare della sua squadra in Serie A nel 2023/2024, avendo collezionato 31 presenze, per un totale di 2770 minuti. É stato scelto nell'11 iniziale in tutte le 31 presenze, su 33 giornate.
La sua ultima partita in Serie A è stata il 21 aprile, partita in cui ha giocato 90 minuti con la maglia del Lecce contro il Sassuolo, nella vittoria per 3-0. Ha ricevuto 8 cartellini gialli, oltre a essere stato espulso 1 volta.
Il Lecce occupa il 13° posto in classifica, con 35 punti, e nella prossima partita di Serie A, il 27 aprile, dovrà giocare una gara casalinga contro il Monza.
Pongracic ha giocato 9 partite di Serie A nell'ultima stagione con il Lecce.
An agosto 2022 Pongracic, in quel periodo giocatore del Wolfsburg, ha iniziato a giocare per il Lecce in prestito. Ha collezionato 21 presenze in campionato in totale con il Wolfsburg, realizzando due gol. Il suo passaggio a giocatore del Lecce è stato definitivo a luglio 2023.
Il 28 agosto 2022 Pongracic ha debuttato in Serie A, a 24 anni e 351 giorni contro l'Empoli. Finora in Serie A, ha giocato 40 partite, senza gol e senza assist.