Niklas Hauptmann del Dynamo Dresden è sceso in campo nella maggior parte delle partite della sua squadra in 2. Bundesliga nel 2025/2026, avendo collezionato 31 presenze, per un totale di 2247 minuti. É partito titolare in 28 di queste presenze, su 34 giornate, ed è entrato a gara in corso 3 volte.
Hauptmann ha collezionato la sua ultima presenza il 17 maggio, con Dynamo Dresden: una vittoria per 2-1 contro l'Holstein Kiel, in cui ha giocato 74 minuti. Il centrocampista ha segnato 5 gol in questo campionato. Ha ricevuto 4 cartellini gialli.
É stato contro Preußen Münster il 15 marzo che Hauptmann ha segnato il suo ultimo gol, avendo realizzato una doppietta nella vittoria per 6-0. Ha aperto le sue marcature in questo campionato contro l'Arminia Bielefeld il 24 agosto, avendo realizzato una rete nella vittoria per 2-1.
Hauptmann ha giocato 37 partite di 3. Liga nell'ultima stagione con Dynamo Dresden, gare in cui ha segnato 6 gol e fornito 6 assist vincenti.
Prima di arrivare a vestire la maglia del Dynamo Dresden nell'agosto 2022, Hauptmann ha collezionato 11 presenze in campionato con Köln II, per un totale di 3 gol.
Il 6 agosto 2016 Hauptmann ha debuttato in 2. Bundesliga, a 20 anni e 40 giorni contro il Norimberga. In generale in 2. Bundesliga, ha giocato 128 partite, con 7 gol e 11 assist.