Jan Mlakar è un attaccante del Pisa che ha giocato nella maggior parte delle partite del club in Serie B nel 2023/2024, avendo collezionato 23 presenze, per un totale di 1427 minuti. É partito titolare in 16 presenze su 36 giornate ed è subentrato 7 volte.
La sua ultima presenza nella competizione è stata l'1 maggio, partita in cui ha giocato 45 minuti con la maglia del Pisa contro la Cremonese, nella sconfitta per 2-1. In totale l'attaccante ha segnato 3 gol in questa stagione - terzo a pari merito tra i giocatori del suo club; ha inoltre fornito 2 assist.
L'ultimo gol di Mlakar in campionato è arrivato nel pareggio 2-2 contro Modena, il 28 febbraio. Ha aperto le sue marcature in questo campionato contro l'Ascoli il 23 dicembre, con una rete nella vittoria per 1-0.
La gara casalinga contro Südtirol, il 5 maggio, sarà la prossima sfida di Serie B per il Pisa, che ha 45 punti e occupa il 10° posto.
Nell'ultima stagione con Hajduk Split in HNL Mlakar ha collezionato 33 presenze, realizzando 11 gol e fornendo 1 passaggio vincente.
Prima di cominciare l'esperienza con il Pisa nell'agosto 2023, l'attaccante ha collezionato 64 presenze in campionato con Hajduk Split, per un totale di 18 reti e 3 assist.