Youssouf Ndayishimiye è un centrocampista del Nizza che è sceso in campo nella maggior parte delle partite della sua squadra in Ligue 1 nel 2023/2024, avendo collezionato 23 presenze, per un totale di 1714 minuti. É stato scelto nell'11 iniziale in 20 presenze su 34 giornate ed è entrato 3 volte.
L'ultima partita di Ndayishimiye in campionato è stata il 10 maggio, partita in cui ha giocato 15 minuti con la maglia del Nizza contro il Le Havre, nella vittoria per 1-0. Ha ricevuto 6 cartellini gialli, oltre a essere stato espulso 1 volta.
Nell'ultima stagione con il Nizza in Ligue 1 Ndayishimiye ha collezionato 10 presenze, gare in cui ha segnato 1 gol.
Ndayishimiye ha iniziato la sua esperienza con il Nizza nel gennaio 2023, mentre prima giocava con l'Istanbul Ba?ak?ehir, con cui ha collezionato 58 presenze in campionato, con 5 gol e 3 assist.
Il 29 gennaio 2023 Ndayishimiye ha debuttato in Ligue 1, a 24 anni e 94 giorni contro il Lilla. In generale in Ligue 1, ha giocato 33 partite, con 1 gol.