Andi Zeqiri del Genk ha giocato nella maggior parte delle partite della sua squadra in First Division A nel 2023/2024, avendo collezionato 24 presenze, per un totale di 736 minuti. É stato scelto nell'11 iniziale in 7 presenze su 35 giornate ed è stato utilizzato spesso come subentrato, in 17 occasioni.
La sua ultima partita nella competizione è stata il 24 aprile, partita in cui ha giocato 29 minuti con la maglia del Genk contro il Club Brugge, nella sconfitta per 4-0. In totale l'attaccante ha segnato 6 gol nel 2023/2024 - secondo a pari merito tra i giocatori del suo club.
É stato contro l'Anderlecht il 20 aprile che Zeqiri ha segnato il suo ultimo gol, nella vittoria per 2-1. Ha aperto le sue marcature in questo campionato contro Union Saint-Gilloise il 16 settembre, avendo realizzato una rete nella vittoria per 2-0.
Il Genk è attualmente al 4° posto nella classifica stagionale, con 34 punti, e nella prossima partita di First Division A, il 28 aprile, dovrà giocare una gara casalinga contro il Club Brugge.
Nell'ultima stagione con Basel in Super League Zeqiri ha collezionato 30 presenze, realizzando 11 gol.
Prima di cominciare l'esperienza con il Genk nel settembre 2023, l'attaccante ha collezionato 9 presenze in campionato con il Brighton.